Alphonse Vergès  s'est engagé comme colonel au 1er régiment de chasseurs à cheval et a occupé la fonction de sous-chef d'état-major de la XVIIe légion fédérée.

Après la défaite de la Commune il parvient à fuir et à se réfugier à Genève en juin 1871. En son absence, il a été condamné par contumace en 1873 à la déportation dans une enceinte fortifiée.

Depuis son exil en Suisse, il est resté un défenseur actif de la Commune. Il a fondé le journal Le Charivari helvétique et a publié plusieurs brochures et pamphlets politiques défendant les communards et critiquant le gouvernement d'Adolphe Thiers, notamment l'ouvrage La Vérité sur le gouvernement de la Défense nationale, la Commune et les Versaillais (1871) ainsi que Le coin du voile (1872).